CaverDock
Hledáme cestu labyrintem
CAVERDOCK
- Softwarový nástroj pro rychlou analýzu transportních procesů v bílkovinách
- Zjišťujeme, jak se malá molekula (např. lék) může dostat dovnitř bílkoviny
CO UMÍME?
- Simulujeme přesun malých molekul
- Pohyb tunelem v bílkovině simulujeme kombinací molekulového dockingu a hledáním spojité trajektorie
PROČ CAVERDOCK?
- Je přesnější než geometrické metody
- Je rychlejší než molekulová dynamika
- Pomáhá vyvíjet nová léčiva a enzymy
