Vyučující
Fakultní garant studijního oboru
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
- Struktura, evoluce a udržování telomer, jejich úloha při zachování stability chromozomů a ve speciaci rostlin. Charakterizace nukleoproteinových komplexů telomer a telomeráz, analýza interakcí mezi složkami telomer, analýza strukturně-funkčních vztahů subdomén telomerázy a výzkum alternativních (na telomeráze nezávislých) strategií udržování telomer
- Epigenetické mechanizmy regulace genové exprese, stability chromosomů a údržby telomer
Garanti studijního oboru
Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Studijní podklady
- Stanovení strukturně funkčních vztahů při vytváření nukleoproteinových komplexů nezbytných pro správnou funkci a zachování genomu.
- Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami za použití kvantitativních biofyzikálních přístupů – fluorescenční spektroskopie, biokalorimetrie.
Mgr. Miloslava Fojtová, CSc.
- Evoluce, struktura a stabilita rostlinných telomer; mechanizmy regulace aktivity telomerázy během vývoje rostlin
- Úloha epigenetických modifikací a molekul RNA v regulaci exprese genů; vliv faktorů prostředí na rostlinný genom a epigenom
RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
- Funkční genomika a proteomika hormonálních regulací vývoje rostlin
- Molekulární mechanizmy umožňující integraci (spojování a vzájemné ovlivňování) různých typů signálu do jednoho signálního výstupu prostřednictvím tzv. vícekrokového přenosu fosfátu (multistep pohosphorelay) a jakým způsobem na tento integrovaný signál rostlinná buňka reaguje
Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.
- Analýza proteinových interakcí a architektura proteinových komplexů
- Komplexy SMC (structure maintenance of chromosome) a evoluce proteinů MAGE (melanoma-associated antigen)
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D.
- Krystalizace proteinů a řešení 3-D struktur biologických makromolekul pomocí difrakce RTG záření na monokrystalech, SAXS (maloúhlový rozptyl RTG záření)
doc. Mgr. Martin Lysák, Ph.D.
- Struktura a evoluce karyotypu a genomu, evoluční význam přestaveb chromosomů a karyotypů, evoluce repetitivních sekvencí, komparativní cytogenomika rostlin.
- Sekvenace celých genomů, fylogenomika rostlin; celogenomové duplikace (polyploidie) různého evolučního stáří
doc. Mgr. Jan Havliš, Dr.
- Funkční proteomika asistovaná hmotnostní spektrometrií – identifikace komponent proteinových směsí či proteinových komplexů, kvantifikace proteinů ve směsích
- Separační metody v bioanalytice – proteiny, peptidy, oligonukleotidy a metabolity; chromatografie na obrácené fázi (RPLC), chromatografie s hydrofilními interakcemi (HILIC), gelová elektroforéza (PAGE)
doc. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
- Expresní proteomika asistovaná hmotnostní spektrometrií – identifikace proteinů, relativní kvantifikace, proteinové profilování
- Post-translační modifikace – fosforylace, acylace, alkylace, glykosylace; jejich identifikace a kvantifikace